ABCMdb

PMID: 11232455

Federici S, Iron A, Reboul MP, Desgeorges M, Claustres M, Bremont F, Bieth E
[CFTR gene analyis in 207 patients with cystic fibrosis in southwest France: high frequency of N1303K and 1811+1.6bA>G mutations].
Arch Pediatr. 2001 Feb;8(2):150-7., [PubMed]

Sentences

No. Mutations Sentence Comment

0 ABCC7 p.Asn1303Lys M&#e9;moire original &#c9;tude du g&#e8;ne CFTR chez 207 patients du Sud-Ouest de la France atteints de mucoviscidose : fr&#e9;quence &#e9;lev&#e9;e des mutations N1303K et 1811+1,6kbA>G S. Federici1 , A. Iron2 , M.P. Reboul2 , M. Desgeorges3 , M. Claustres3 , F. Bremont4 , E. Bieth1 * 1 G&#e9;n&#e9;tique m&#e9;dicale, pavillon Lefebvre, h&#f4;pital Purpan, place du Docteur-Baylac, 31059 Toulouse cedex, France ; 2 biochimie et g&#e9;n&#e9;tique mol&#e9;culaire, h&#f4;pital Pellegrin, place Am&#e9;lie-Raba-L&#e9;on, 33076 Bordeaux cedex, France ; 3 institut de biologie, 4, boulevard Henri-IV, 34060 Montpellier cedex, France ; 4 pneumologie p&#e9;diatrique, h&#f4;pital des Enfants, 330, avenue de Grande-Bretagne, 31026 Toulouse cedex, France (Re&#e7;u le 27 mars 2000 ; accept&#e9; le 24 septembre 2000) R&#e9;sum&#e9; L`importante h&#e9;t&#e9;rog&#e9;n&#e9;it&#e9; all&#e9;lique de la mucoviscidose repr&#e9;sente la principale difficult&#e9; pour l`&#e9;tablissement de son diagnostic g&#e9;notypique. Login to comment 8 ABCC7 p.Arg334Trp ABCC7 p.Asn1303Lys Deux autres mutations, N1303K (7,9 %) et R334W (2,6 %), ont aussi une fr&#e9;quence inhabituellement &#e9;lev&#e9;e. Login to comment 12 ABCC7 p.Asn1303Lys (c) 2001 &#c9;ditions scientifiques et m&#e9;dicales Elsevier SAS mucoviscidose / CFTR / conseil g&#e9;n&#e9;tique Summary - CFTR gene analysis in 207 patients with cystic fibrosis in southwest France: high frequency of N1303K and 1811+1.6kbA>G mutations. Login to comment 23 ABCC7 p.Arg334Trp ABCC7 p.Asn1303Lys The frequencies of N1303K, 1811+1.6kbA>G and R334W mutations were also clearly increased: 7.9 and 2.6%, respectively. Login to comment 35 ABCC7 p.Gly551Asp ABCC7 p.Trp1282* D`autres exemples de disparit&#e9;s r&#e9;gionales et ethniques sont connus : proportion importante des mutations G551D (6,9 %) et W1282X (48 %) chez les patients respectivement celtes et juifs ashk&#e9;nazes [4]. Login to comment 36 ABCC7 p.Tyr122* Dans certaines populations constitu&#e9;es plus r&#e9;cemment, l`importance d`un effet fondateur appara&#ee;t encore plus significativement, c`est le cas, par exemple, de la population de l`&#ee;le de la R&#e9;union dans laquelle la mutation Y122X repr&#e9;sente presque la moiti&#e9; des all&#e8;les CF [5]. Login to comment 42 ABCC7 p.Asn1303Lys Nous montrons qu`il existe dans cette population un spectre mutationnel sp&#e9;cifique avec notamment une fr&#e9;quence significativement augment&#e9;e pour les mutations 1811+1,6kbA>G et N1303K. Login to comment 47 ABCC7 p.Gly551Asp ABCC7 p.Trp1282* ABCC7 p.Arg553* ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Le criblage des mutations a &#e9;t&#e9; effectu&#e9; par &#e9;tapes avec des m&#e9;thodes incluant toutes une amplification pr&#e9;alable par PCR (polymerase chain reaction) suivie d`une d&#e9;tection des h&#e9;t&#e9;roduplexes pour la mutation ࢞F508 ou d`une analyse par hybridation en dot blot inverse avec la trousse INNO-Lipa CF8 (Innogenetics, Zwiljnaarde, Belgique) pour les mutations ࢞F508, G542X, N1303K, G551D, R553X, W1282X, 1717G>A et ࢞I507. Login to comment 58 ABCC7 p.Arg334Trp ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Cinq autres mutations ont une fr&#e9;quence sup&#e9;rieure &#e0; 1 % : G542X (5,3 %), N1303K (3,9 %), 1811+1,6kbA>G (3,4 %), 1717-1G>A (1,4 %) et R334W (1,2 %). Login to comment 61 ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Origine g&#e9;ographique (% all&#e8;les) Sud-Ouest (nos donn&#e9;es) France [6] Italie/Espagne [12, 16] a b c d/e (n = 414) (n = 114) (n = 7 190) (n = 3 492/1 944) ࢞F508 64,2 57 67,21 51/50,6 G542X 5,3 5,3 2,89 5/8 N1303K 3,9 7,9 2,05 5/ ? Login to comment 63 ABCC7 p.Gly551Asp ABCC7 p.Arg553* ABCC7 p.Arg334Trp ABCC7 p.Arg1162* ABCC7 p.Arg792* ABCC7 p.Tyr1092* /2 1717-1G>A 1,4 1,7 1,33 R334W 1,2 2,6 < 0,5 R553X 0,9 0,9 0,87 G551D 0,7 0,9 0,97 Delta I507 0,7 0,9 0,66 4005+1G>A 0,7 < 0,5 < 0,5 R792X 0,7 < 0,5 < 0,5 R1162X 0,5 < 0,5 < 0,5 1717-8G>A 0,5 < 0,5 < 0,5 2789+5G>A 0,5 < 0,5 < 0,5 3849+10kbC>T 0,5 0,9 < 0,5 3737 del A 0,5 1,7 < 0,5 Y1092X 0,5 0,9 < 0,5 3905 ins T 0,5 < 0,5 < 0,5 32 mutations rares* 7,8 6,1 ND All&#e8;les non caract&#e9;ris&#e9;s 5,6 4,4 6,8 a : fr&#e9;quence all&#e9;lique pour l`ensemble de la s&#e9;rie (207 patients) ; b : fr&#e9;quence all&#e9;lique pour les patients originaires du Sud-Ouest (57 patients) ; c : fr&#e9;quence all&#e9;lique dans la population fran&#e7;aise [6] ; d : fr&#e9;quence all&#e9;lique en Italie [12] ; e : fr&#e9;quence all&#e9;lique en Espagne [16] ; * 32 mutations diff&#e9;rentes (connues) retrouv&#e9;es en un seul exemplaire ; ND : non d&#e9;termin&#e9;. Login to comment 69 ABCC7 p.Asn1303Lys &#c0; l`oppos&#e9;, certaines mutations rares ou tr&#e8;s rares &#e0; l`&#e9;chelle nationale se r&#e9;v&#e8;lent relativement fr&#e9;quentes dans le Sud-Ouest : c`est le cas, par exemple, des mutations N1303K et surtout 1811+1,6kbG>A qui sont responsables de formes s&#e9;v&#e8;res de mucoviscidose. Login to comment 70 ABCC7 p.Asn1303Lys La mutation N1303K, port&#e9;e par 3,9 % des chromosomes CF, a ainsi la fr&#e9;quence r&#e9;gionale la plus &#e9;lev&#e9;e en France (seul taux comparable : Grenoble [6]). Login to comment 72 ABCC7 p.Asn1303Lys Fr&#e9;quente dans les pays m&#e9;diterran&#e9;ens (17 % en Tunisie [4]), la mutation N1303K entra&#ee;ne l`absence de maturation de la prot&#e9;ine et son incapacit&#e9; &#e0; se fixer sur la membrane apicale de la cellule, expliquant le ph&#e9;notype s&#e9;v&#e8;re avec insuffisance pancr&#e9;atique. Login to comment 76 ABCC7 p.Gly542* La mutation G542X, d&#e9;j&#e0; connue pour avoir une fr&#e9;quence &#e9;lev&#e9;e dans le sud de l`Europe et les pays m&#e9;diterran&#e9;ens [2], repr&#e9;sente 5,3 % des chromosomes CF de notre s&#e9;rie alors que la fr&#e9;quence nationale est de 2,9 %. Login to comment 77 ABCC7 p.Gly542* L`analyse des chromosomes CF originaires du seul Sud-Ouest depuis au moins deux g&#e9;n&#e9;rations montre une fr&#e9;quence identique de 5,3 %, sugg&#e9;rant que l`augmentation de fr&#e9;quence de G542X par rapport &#e0; la moyenne nationale n`est pas li&#e9;e &#e0; un effet fondateur. Login to comment 78 ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Pour ces quatre mutations, ࢞F508, N1303K, 1811+1,6kbA>G et G542X, les deux distributions (population fran&#e7;aise et population du Sud-Ouest) sont significativement diff&#e9;rentes au seuil de 5 % (p < 0,05). Login to comment 79 ABCC7 p.Arg334Trp Deux autres mutations, 1717-1G>A et R334W, ont une fr&#e9;quence sup&#e9;rieure &#e0; 1 %. Login to comment 81 ABCC7 p.Arg334Trp Cette fr&#e9;quence &#e9;lev&#e9;e de R334W semble &#ea;tre une caract&#e9;ristique r&#e9;gionale puisqu`elle est nettement augment&#e9;e dans les chromosomes typiquement du Sud-Ouest. Login to comment 82 ABCC7 p.Arg334Trp La mutation R334W est &#e0; l`origine d`une prot&#e9;ine CFTR &#e0; conductivit&#e9; ionique diminu&#e9;e et d`un ph&#e9;notype moins s&#e9;v&#e8;re sans insuffisance pancr&#e9;atique. Login to comment 85 ABCC7 p.Asn1303Lys La fr&#e9;quence inhabituelle des g&#e9;notypes comportant les mutations N1303K ou 1811+1,6kbA>G nous a incit&#e9;s &#e0; rechercher des liens avec des haplotypes particuliers du g&#e8;ne CFTR. Login to comment 87 ABCC7 p.Asn1303Lys Le tableau III montre qu`&#e0; partir des 16 chromosomes portant la mutation N1303K, quatre haplotypes diff&#e9;rents ont &#e9;t&#e9; obtenus dont un (23-31-13) qui caract&#e9;rise la moiti&#e9; de ces chromosomes. Login to comment 89 ABCC7 p.Asn1303Lys Ce r&#e9;sultat sugg&#e8;re que la mutation 1811+1,6kbA>G a une origine plus r&#e9;cente que N1303K et que sa fr&#e9;quence &#e9;lev&#e9;e dans notre r&#e9;gion doit &#ea;tre reli&#e9;e &#e0; un effet fondateur dans la r&#e9;gion sud-ouest de l`Europe. Login to comment 104 ABCC7 p.Asn1303Lys Fr&#e9;quence des haplotypes* li&#e9;s aux all&#e8;les N1303K et 1811+1,6kbA>G. Login to comment 105 ABCC7 p.Asn1303Lys Haplotypes* Pourcentage Origine g&#e9;ographique (n chromosomes) N1303K 23-31-13 50 Sud-Ouest (n = 3) Nord (n = 1) Inconnue (n = 4) 24-31-13 37,5 Sud-Ouest (n = 4) Espagne (n = 1) Inconnue (n = 1) 16-29-13 6,25 Sud-Ouest (n = 1) 23-31-32-13 6,25 Espagne (n = 1) 1811+1,6kbA>G 16-46-13 93 Sud-Ouest (n = 10) Inconnue (n = 3) 16-45-13 7 Sud-Ouest (n = 1) * IVS8CA-IVS17bTA-IVS17bCA. l`analyse du g&#e8;ne CFTR peut &#ea;tre poursuivie en fonction des donn&#e9;es cliniques et du r&#e9;sultat du chlore sudoral. Login to comment 124 ABCC7 p.Asn1303Lys En &#ab; sensibilisant &#bb; ainsi l`analyse du spectre des mutations CF du Sud-Ouest, il s`av&#e8;re que deux mutations, N1303K et 1811+1,6kbA>G, ont une fr&#e9;quence &#e9;tonnamment augment&#e9;e. Login to comment 132 ABCC7 p.Asn1303Lys Pour la mutation N1303K dont la fr&#e9;quence est tr&#e8;s &#e9;lev&#e9;e comparativement aux autres r&#e9;gions de France, l`analyse des marqueurs microsatellites retrouve une association d&#e9;j&#e0; d&#e9;crite &#e0; quatre haplotypes diff&#e9;rents sans que l`on parvienne &#e0; &#e9;tablir de relation avec l`origine g&#e9;ographique des all&#e8;les analys&#e9;s. Login to comment 133 ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Ces r&#e9;sultats sont en accord avec d`autres donn&#e9;es sugg&#e9;rant que la mutation N1303K fait partie avec ࢞F508 et G542X des trois mutations apparues il y a plus de 30 000 ans [9, 10]. Login to comment 143 ABCC7 p.Asn1303Lys ABCC7 p.Gly542* Enfin, si les quatre mutations les plus fr&#e9;quentes du Sud-Ouest (࢞F508, G542X, N1303K et 1811+1,6kbA>G) ne sont pas retrouv&#e9;es, le risque r&#e9;siduel n`est que de 1/130, montrant l`int&#e9;r&#ea;t d`un d&#e9;pistage cibl&#e9; des mutations, avec en particulier la recherche de la mutation 1811+1,6kbA>G chez les patients originaires de cette r&#e9;gion. Login to comment 144 ABCC7 p.Arg1162* ABCC7 p.Arg1162* En revanche, nous montrons que certaines mutations r&#e9;put&#e9;es comme relativement fr&#e9;- quentes, telles que R1162X ou 621+1G>T ne sont qu`exceptionnellement retrouv&#e9;es dans notre population. Il semblerait donc plus judicieux de r&#e9;server cette recherche aux patients dont les origines g&#e9;ographiques ou ethniques font pr&#e9;voir, sur la base de donn&#e9;es &#e9;pid&#e9;miologiques, une forte pr&#e9;valence : Alg&#e9;rie, nord de l`Italie [2] et Tyrol [13] pour la mutation R1162X, Gr&#e8;ce centrale [4], Pays de Galles [14] et Qu&#e9;bec [15] pour la mutation 621+1G>T, par exemple. Login to comment